繼筆者於2017/4發表關於新英格蘭醫學雜誌（The New England Journal of Medicine, NEJM）的統計分析之歷年趨勢（網址連結：https://goo.gl/IJ7eSQ），本次分享另一頂尖醫學期刊美國醫學協會雜誌（Journal of the American MedicalAssociation, JAMA，2015年Impact Factor：37.7）的統計方法分析，本篇報告刊登在2013年的PLOS ONE（連結：https://goo.gl/oLRNkT），是經過同儕審核的文章，之前關於NEJM那一篇文章僅是評論，在學術嚴謹度略有差別。
一、研究設計與統計軟體
該文章以1990、2000、2010分別當成早期、中期與近期。首先看到研究設計（Study design），證據等級（Evidence level）較低的描述性研究（Descriptive）、橫斷面研究（Cross-sectional）與個案對照研究（Case-control）的比例有逐年降低的趨勢。從1990到2000的時期，證據等級最高的隨機對照試驗（RCT）與世代研究（Cohort study）的比例大幅上升。
另外可注意到統合分析（Meta-analysis）或系統性回顧（Systematic review）從2000年到2010年，使用比例從4.1%大幅上升到16.0%，表示學術界對於次級資料研究（Secondary study）的重視度越來越高。不過可惜的是，作者沒有列出資料庫類型的研究，例如健保資料庫或是其他登錄資料庫的研究，或許作者們是歸在世代研究或其他類型的研究。
關於統計分析的軟體，在1990、2000時期分別高達83.3%、52.6%的文章未載明使用的統計軟體，而到了2010年已經高達99%的文章都會交代統計分析的軟體為何。交代使用的統計軟體是必要的，不同於一些基礎的統計分析（例如t-test, correlation），進階的統計分析往往會涉及到演算法（Algorithm）與迭代（Iteration）的設定，而各種統計軟體的預設往往不同，也會導致計算後的結果可能有所出入，因此主動報告使用統計分析軟體變成是必要項目之一。
不過筆者認為作者們漏了一個很重要的統計分析軟體：『R』，此軟體的分析功能非常強大，幾乎各種最新研發的統計技術，在不久的時間內就會有研究者上傳並開放套件（Package）下載，筆者相信在2010至2017年的現在，應該超過10%的論文會有一部份的分析是採用R軟體所計算的。
二、統計分析方法
跟上一次的NEJM分析結果類似（網址連結：https://goo.gl/IJ7eSQ），流行病學統計（Epidemiologic statistics）、檢定力分析（Power analysis）與存活分析（Survival analysis，包含log-rank test）的使用比例穩定上升，原因筆者已經論述過，不再贅述。另外還有意向分析（Intention to treat）的使用比例也上升，這與JAMA刊的文章多屬RCT有關。
值得注意的是，卜瓦松迴歸（Poisson regression）在1990年沒有被使用過，但到了2000、2010年分別有9%、7.5%的使用比例。卜瓦松迴歸適用於結果變項為計數性質（Count），而臨床研究有許多變項符合計數變項的條件，例如癲癇發作次數、住院次數等變項，其不適合用常態分配與平均數、標準差分析之，而需以卜瓦松分布與log轉換來分析。
Multi-level modeling（多層次模型）的使用比例一直上升，到了2010年已經有32.1%，幾乎三分之一的文章使用它。筆者多年前曾經做過簡介（連結網址：https://goo.gl/LIO74l），此分析可以透過隨機效果（Random effect）處理多層次資料的集群效果（Clustered effect）與重複測量的縱貫資料類型（Longitudinal data analysis）。
另外，敏感度分析（Sensitivity analysis）到了2010年幾乎有50%的文章都會採用，敏感度分析涵蓋範圍非常廣，簡單來說就是「本研究的發現是否會在某些操作條件之下而改變」，例如換個統計模型、參數設定或調整研究族群，原則上就是換個條件重複執行主要分析（Primary analysis），確認原本的結果不會受到其他條件設定的影響。
三、結論
由上述結果可知，JAMA使用的統計分析的難度越來越高，包括Multi-level modeling與Sensitivity analysis都算是進階分析，因此可知在醫學研究中，研究者想要獨立完成統計分析的難度越來越高，於是生物統計分析員（Biostatistician）的角色越趨重要，而且對於研究者來說，也必須瞭解這些進階統計分析方法的使用時機與結果解讀，才不會跟不上頂尖研究進步的潮流。
四、延伸閱讀
NEJM的統計方法使用趨勢，Statistical Methods in the Journal — An Update
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