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操作方法一(交叉表)

1)點選「分析」→「敘述統計」→「交叉表」。

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在進行連續變項的前後測比較或配對比較時,我們會用到一個熟悉的統計方法-成對樣本t檢定(Paired sample t test),不過當變項屬於二分類的類別變項時,我們就必須改用一個比較陌生的檢定方式-麥內瑪關聯樣本檢定(McNemar test)。先來介紹這次的例子,針對100名受訪者,詢問他們在政見發表會前後,對於候選人的支持情況,資料的建立通常有兩種方式,左邊的方式,直接記錄每一位受訪者在政見發表會前後所支持的候選人,因此樣本數會有100筆;右邊的方式,則是將四種反應組合列出後,在第三個欄位中填上該組合下的人數。

 

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三、MethodsItem no. 10-12

10 點是關於統計分析,是只針對發展模型的文章,又分成 5 個小點。「10a」是描述在分析時如何處理預測變項,這邊指的是主要分成連續變項與類別變項兩大類。連續變項部分,TRIPOD statement 建議盡量保持為連續變項,避免重新分組成類別變項,尤其是根據資料驅動(Data-driven)的二分法(Dichotomization)更要避免使用。連續變項也要檢視與結果變項之間的非線性關係,目前主要建議使用 fractional polynomialFP)以及 restricted cubic splinesRCS),兩者中又以 FP 的模型可解釋性比較高。關於 RCS,筆者與同事之前有分享過一些文章(https://reurl.cc/8WOqNbhttps://reurl.cc/pWVL54https://reurl.cc/R6OEqG以及https://reurl.cc/2b8yjm)。

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三、MethodsItem no. 4-9

第二個部分是方法,多達 9 項(4-12),是 TRIPOD 最主要的內容,所以筆者分成兩篇撰述,以下分別解釋。

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現今的醫學研究在投稿時,雜誌社往往會要求檢附報告指引(Reporting guideline)的檢核表,主要是為了讓研究人員自我審視關於研究執行與報告的細節,是否符合規範。關於報告指引,筆者在過去曾經寫過綜合的介紹(https://reurl.cc/NpEade)、針對統合分析的 PRISMA checklisthttps://reurl.cc/ZrznkA)以及針對例行性收集資料的 RECORD checklisthttps://reurl.cc/Kpv6W9以及https://reurl.cc/oeqDMv)。

本篇文章主要欲介紹「TRIPOD statement」,為 Transparent Reporting of a multivariable prediction model for Individual Prognosis Or Diagnosis 的縮寫,是針對「多變項預測模型」的報告指引。跟其他報告指引一樣,「TRIPOD statement」有完整的發展歷程以及持續更新,可至官方網站下載最新文章與勘誤表等資訊(https://www.tripod-statement.org/)。

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值得注意的是,報表最下方有兩個「BIC」,要以第二個為主(N= 1063),數值是「-13285.31」。

接著執行三組皆為線性的組合「1 1 1」,只要將程式些微修改成『ngroups 3 ; order 1 1 1』即可。此時報表第二個 BIC 數值為「-13235.15」,我們用比較複雜模型「1 1 1」減掉比較簡單模型「1 1」的數值,然後再乘以兩倍,亦即 [-13235.15 – (-13285.31)] x 2 結果是正的「100.32」,這代表有非常強烈的證據顯示此時的複雜模型「1 1 1」的配適結果比較好。

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筆者在之前介紹了Group-based trajectory modelGBTM)的概念,本系列文章以 Bobby Jones 撰寫的 SAS 程式「Proc TRAJ」為例,以一個實際已發表的例子來示範操作流程。Bobby Jones 有固定在更新及維護這個程式,可至此網址下載最新程式以及參考說明(https://www.andrew.cmu.edu/user/bjones/)。

首先至網頁的「SAS download」頁面,根據作業系統與 SAS 版本下載程式的壓縮檔,根據網頁中的指示,將「traj.dll」放到作業系統(通常是 C 槽)的「sasexe」資料夾,以及其他檔案(dropoutplottrajplottrajplotnewtrajtest)放到「sasmacro」的資料夾。以我的電腦路徑為例,是C:\Program Files\SASHome\SASFoundation\9.4\core\sasmacro以及C:\Program Files\SASHome\SASFoundation\9.4\core\sasexe

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筆者之前有寫一篇關於Tidyverse的介紹,” R 資料的魔法師-Tidyverse (1)”,已經介紹了Tidyverse裡常用的package,包含readrtidyrTibbledplyr的使用,接下來筆者會針對剩下常用的package作介紹(如下圖所示)

 

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在資料科學的領域中,資料的處理大致是下圖的流程,從匯入資料、資料前處理(TidyTransform)、資料的探勘(視覺化:visualise、建模:model)、數據呈現。

 

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